Η Δομή Υποστήριξης Εκπαίδευσης Προσφύγων (Δ.Υ.Ε.Π.) λειτουργεί στο Σχολείο μας από το Νοέμβριο του 2018. Για το Σχολικό Έτος 2019-2020 η λειτουργία της εν λόγω δομής ξεκίνησε στις 17 Φεβρουαρίου 2020. Φέτος εργάζονται στη Δ.Υ.Ε.Π. τέσσερις εκπαιδευτικοί. Ο Υπεύθυνος για τη λειτουργία του Τμήματος, Δάσκαλος Παντελής Καλαμάρης, η Καθηγήτρια Αγγλικής Κατερίνα Χούλη, η Καθηγήτρια Πληροφορικής Μαίρη Τόδη και η Καθηγήτρια Φυσικής Αγωγής Χριστίνα Πετράκη. Συντονίστρια Εκπαίδευσης Προσφύγων (Σ.Ε.Π.) για τη Χίο είναι η Γεωργία Χριστοφοράκη, Καθηγήτρια Φυσικής Αγωγής. Η Δομή λειτουργεί με συγκεκριμένο πρόγραμμα εργάσιμες μέρες από 13.00΄ έως 18.00΄.